怎样快速找到基因序列的开放阅读框(ORF)
的有关信息介绍如下:基因序列往往包含不能被翻译的部分和能被翻译的部分,开放阅读框部分的序列可被全部翻译成氨基酸序列,对于基因和蛋白质序列的研究有很大帮助。网上有很多朋友也在询问相关的内容,那么,怎样快速找到ORF呢?小编经常使用一个工具ORF Finder,特别好用,不信你也试试。
打开”ORF Finder“
“ORF Finder“是在线搜索ORF的实用小工具,百度搜索“ORF Finder”,点击第一个,打开这款在线工具。
复制基因序列
不管是使用DNAStar中的Editseq打开基因序列,还是直接在NCBI中复制序列,总之,复制基因序列,或者记住序列的GI号,后面的步骤会用到。
输入序列
ORF Finder输入基因信息可以是GI号,也可以是复制粘贴的全部序列,选择一个即可,然后点击“orfFind”,开始搜索。
ORF分析
以H9禽流感病毒HA基因为例说明,我们看到这条HA基因包含6个ORF,其中+1最长、最完整,囊括了整条基因,其他都是小段。随意点击一段,颜色会改变,并且出现翻译的氨基酸的数量和其他信息等等。
清除序列
如果你有多条序列需要查找ORF,点击返回,显示首页,点击右侧的“clear”就能清除当前的序列,重新复制粘贴新的序列就可以了,这个方法是不是很快捷啊。